Archivi per la categoria ‘Proteomica’

Analisi proteine e ricerca antibiotici nel latte

Lunedì, 11 Maggio 2009

Le tecniche di analisi LC MASSA trovano impiego in numerose aree investigative. E’ così possibile effettuare analisi del profilo proteico e peptidico, ricerca di antibiotici e tracce di contaminanti in prodotti alimentari, quali il latte, in riferimento ai risvolti igienico-sanitari ed ai sempre più frequenti tentativi di sofisticazioni alimentari.
Ulteriori dettagli ed informazioni possono essere reperite al seguente link:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16369930?ordinalpos=10&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Pubmed.Pubmed_ResultsPanel.Pubmed_DefaultReportPanel.Pubmed_RVDocSum


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Proteomica quantitativa

Mercoledì, 29 Aprile 2009

Nell’ambito della proteomica quantitativa la Spettrometria di Massa (MS) riveste un ruolo importante per l’identificazione delle proteine differentemente espresse (in differenti stadi fisiologici o patologici). L’elaborazione dei dati necessita dell’utilizzo di tools e software specifici. Un articolo interessante di Brusniak e colleghi descrive un « framework » per questi studi (’Corra: Computational framework and tools for LC-MS discovery
and targeted mass spectrometry-based proteomics’ BMC Bioinformatics 2008, 9:542) .


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Proteine

Giovedì, 9 Aprile 2009

E’ stato recentemente pubblicato un articolo interessante, che descrive un approccio bioinformatico innovativo per l’analisi di dati di proteine, acquisiti mediante tecniche di spettrometria di massa ad alta accuratezza.

I riferimenti bibliografici sono i seguenti : Jaitly N, Mayampurath A, Littlefield K, Adkins JN, Anderson GA, Smith RD. 2009. Decon2LS: An open-source software package for automated processing and visualization of high resolution Mass Spectrometry Data. BMC Bioinformatics. Mar 17;10(1):87 [Epub ahead of print].

Il paper é facilmente rintracciabile eseguendo una ricerca sul sito dell’NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/).


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