Nell’ambito della proteomica quantitativa la Spettrometria di Massa (MS) riveste un ruolo importante per l’identificazione delle proteine differentemente espresse (in differenti stadi fisiologici o patologici). L’elaborazione dei dati necessita dell’utilizzo di tools e software specifici. Un articolo interessante di Brusniak e colleghi descrive un « framework » per questi studi (’Corra: Computational framework and tools for LC-MS discovery
and targeted mass spectrometry-based proteomics’ BMC Bioinformatics 2008, 9:542) .

Altri Post di Approfondimento ...

• Identificazione di due proteine batteriche associate alle endocarditi
• Analisi sulle proteine e proteomica funzionale
• Nuova tecnologia USIS
• Analisi di parabeni e composti estrogenici in LC-MS/MS
• Ricerca pesticidi
• Proteine

Presso ISB di Milano, a breve sarà attivato un servizio di analisi acque (potabili, di scarico e di falda), analisi suolo e analisi rifiuti.

Per avere informazioni più dettagliate contattare il laboratorio di analisi al seguente indirizzo e-mail: info@isbiotechnology.com.

Altri Post di Approfondimento ...

• Analisi rifiuti e inquinamento del suolo
• Spettrometria di massa e analisi ambientali nella ricerca di residui fitofarmaci in alimenti

Nei campioni biologici (es. capelli, urine), l’identificazione dei composti di rilevanza farmacologica-tossicologica (es. ricerca di un farmaco, pesticidi, droghe d’abuso, veleni) passa attraverso tecniche di spettrometria di massa MS.
Numerosi databases, commerciali e non, permettono lo screening di tali composti sulla base di parametri specifici quali : massa esatta, pattern isotopico e formula chimica. Le sole librerie LC-MS contengono spettri di all’incirca 1200 composti.
Recentemente Polettini e colleghi (Anal. Chem. 2008, 80:3050-3057) hanno implementato un database per lo screening di metaboliti, droghe e composti correlati a partire da matrici biologiche.

Altri Post di Approfondimento ...

• Analisi pesticidi e utilizzo della tecnica LC-MS
• Ricerca di farmaci

Nell’ambito della tutela della salute umana e della sicurezza alimentare rivestono notevole importanza le tecniche che consentono analisi pesticidi in matrici alimentari.

Tra le metodiche di analisi di maggior utilizzo vi é la cromatografia liquida accoppiata alla spettrometria di massa (LC-MS) che permette, insieme con altri metodi, di identificare i micro-contaminanti dei campioni agro-alimentari, i loro diversi metaboliti “target” nonché i maggiori prodotti di degradazione nel corpo umano.

Le sue potenzialità nel campo applicativo relativo ad analisi pesticidi sono ampliamente illustrate nei seguenti articoli scientifici:

1) Garcia-Jares C, Regueiro J, Barro R, Dagnac T, Llompart M. 2009. Analysis of industrial contaminants in indoor air. Part 2. Emergent contaminants and pesticides. Journal of Chromatrography A 1216(3):567-597.

2) Picot Y, Barcelo D. 2008. The expanding role of LC-MS in analyzing metabolites and degradation products of food contaminants. Trends in Anatytical Chemistry 27(10):821-835.

Altri Post di Approfondimento ...

• Melamina e sofisticazioni alimentari
• Analisi proteine e ricerca antibiotici nel latte
• Ricerca di un farmaco e metaboliti con tecniche LC-MS

E’ stato recentemente pubblicato un articolo interessante, che descrive un approccio bioinformatico innovativo per l’analisi di dati di proteine, acquisiti mediante tecniche di spettrometria di massa ad alta accuratezza.

I riferimenti bibliografici sono i seguenti : Jaitly N, Mayampurath A, Littlefield K, Adkins JN, Anderson GA, Smith RD. 2009. Decon2LS: An open-source software package for automated processing and visualization of high resolution Mass Spectrometry Data. BMC Bioinformatics. Mar 17;10(1):87 [Epub ahead of print].

Il paper é facilmente rintracciabile eseguendo una ricerca sul sito dell’NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/).

Altri Post di Approfondimento ...

• Identificazione di due proteine batteriche associate alle endocarditi
• Proteomica comparativa vegetale
• Spettrometria comparativa e sofwares
• Proteomica quantitativa tramite spettrometria comparativa LC-MS
• Proteomica quantitativa

ISB - laboratorio analisi specializzato nell’analisi di droghe di abuso, svilupperà una nuova tecnologia che permetterà di ridurre i tempi e i costi nell’analisi delle droghe di abuso per il controllo dei lavoratori.

Altri Post di Approfondimento ...

• Analisi sostanze stupefacenti

ISB offre analisi sostanze stupefacenti in capelli : cocaina e suo metabolita, avvalendosi della tecnica “Surface-Activated Chemical Ionization, SACI” (WO/2004/034011).

Un articolo descrittivo, riportante l’alta precisione e stabilità del metodo é disponibile on-line : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17610217?ordinalpos=6&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Pubmed.Pubmed_ResultsPanel.Pubmed_DefaultReportPanel.Pubmed_RVDocSum.

Altri Post di Approfondimento ...

• ISB - laboratorio analisi